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图解从新认识蛋白质!(更新)

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发表于 2009-5-2 15:37 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:12 编辑

David.S.Goodsell                   看前请刷新!


戴维.古德塞尔
美国斯克里普斯研究所副教授。从事针对HIV所具有的一种“蛋白酶”来设计治疗药物的研究。同时还在严格按照科学资料进行表现蛋白质等分子和包含这些分子的细胞形状的图谱的绘制工作。

嗜热核糖体动画。核糖核酸显示橙色,蛋白质为蓝色
     (耐心等,会动的)





这是古德塞尔绘制的在血清中的HIV的样子。图中的粉红色部分是HIV,其余部分塞满蛋白质。



    (耐心等,会动的)




血红蛋白是由氨基酸和血红素(红色的部分)构成,聚集为四个部分。这四个血红素,只要一个结合了氧原子,立刻就会使其他三个变得容易结合氧原子。同样如果一个血红素失去氧原子,其他三个也会变得容易失去氧原子。这样一来,红细胞就能运输氧气了!!




镰刀型红细胞就是由于上述部位发生突变而产生的

我们已经知道酶是一类高效的催化剂,它的神奇能力源于它独有的分子剪刀!每一种酶都只能分解一种物质,酶是通过坑洞来抓住物质,使其剪切成若干的小分子



RNA聚合酶紧紧地抓住DNA(橙色),读取上面的遗传信息,一边合成信使RNA。(红色)



磷酸果糖激酶,*型部位陷捕物质,改变形状,贴近对象,使其容易分解。







葡萄糖磷酸异构酶(黄色为活性部位)



丙酮酸激酶,*部位抓住物质




己糖激酶,活性部位(红色)周围合拢,将对象封闭在内进行分解。





丙酮磷酸异构酶






离子通道:我们知道神经件是靠电信号来传播的,其实就是神经细胞内外的电势差的变化。而这种变化是有离子引起的,而有一类蛋白质专门运输离子的

钾离子通道,是一种能使钾离子通过的蛋白质。当细胞部分扭曲(左)[绿色为钾离子]就打开离子通道,当细胞松弛(右)就关闭通道。



神经细胞中是由离子直接传送信号,而神经细胞之间则是以神经递质来传播。

乙酰胆碱受体(ACHR),这种长的像箩卜的蛋白质镶嵌在细胞膜上,从上到下看(下图)中心有可以打开和闭合的孔洞。





细胞内还有一些专门把蛋白质等物质和细胞器运输到适当的场合的蛋白质。其中之一就是驱动蛋白
上端的球型用来运输物质,下面的两只脚用来踏在微管的外侧”步行移动“,和驱动蛋白结合在一起的红色物质是ATP,驱动蛋白要改变形状,也需要ATP的能量。

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发表于 2009-5-2 17:18 | 显示全部楼层
呵呵,很好的帖子我转下。、
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 楼主| 发表于 2009-5-2 17:41 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:14 编辑

继续!!


转运RNA(tRNA)



绿色荧光蛋白,首次在水母里发现,在蓝色波长范围的光线激发下,会发出绿色萤光。2008年10月8日,日本科学家下村脩、美国科学家马丁·查尔菲和钱永健因为发现和改造绿色荧光蛋白而获得了当年的诺贝尔化学奖。




ATP合成酶,是世界上最小的马达!!积聚在线粒体的氢离子流过合成酶,驱动被称为“FO”的部位旋转,从而带动与“FO”相连的“F1”旋转。F1旋转,把磷酸附在ATP上,从而制造ATP!



肌动蛋白,是组成我们肌肉的蛋白质,象一条有凹凸不平的长条。



肌球蛋白,也是组成肌肉的蛋白质之一,肌球蛋白的左右手会抓住肌动蛋白的凹处,把肌动蛋白拉近,这样一来,我们就能完成收缩肌肉的动作了!!

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发表于 2009-5-3 03:57 | 显示全部楼层
好贴!支持下!继续哦!
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发表于 2009-5-3 10:51 | 显示全部楼层
不错,挺有趣的。 希望放上来源。
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 楼主| 发表于 2009-5-3 22:14 | 显示全部楼层
图片来源http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Poliovirus_binding_receptor_1DGI.png维基

文字说明是自己一字一句的编辑的!!
我还会发的,等等!!
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发表于 2009-5-5 10:27 | 显示全部楼层
呵呵,那好,我也放一个视频~

http://www.ieducation.org.cn/BIO/bio.htm
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 楼主| 发表于 2009-5-24 15:38 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:16 编辑





磷酸甘油酸激酶,当遇到反应物时,活性部分周围弯曲合拢,将对象封闭在内使其发生反应。



烯醇酶,由两种蛋白质构成,各自有活性部位


酶的羟基(红色)攻击一个磷酸基团(粉红色,黄色) ,打破了的RNA链



眼镜蛇的毒液有神经毒素,
神经毒素(红色)会攻击乙酰胆碱受体,使神经信号无法再传播,从而使神经系统瘫痪!



细菌视紫红质(左)和奶牛的视紫红质(右 )[视紫红质:一种与视觉形成的蛋白质]


铁蛋白分子是由24个相同的亚基组成,形成一个能够控制铁离子的核心


人的碳酸酐酶把磺胺(黄绿色)抓住   [碳酸酐酶是红细胞的主要蛋白质成分之一,在红细胞中的地位仅次于血红蛋白]


人的鼻病毒的14面体结构

[
tRNA运输的天门冬氨酸

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 楼主| 发表于 2009-5-24 15:53 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:16 编辑


神经生长因子( NGF )由两个118个氨基酸组成的单链通过非共价键结合而成的二聚体,具有神经元营养和促突起生长双重生物学功能的一种神经细胞生长调节因子,它对中枢及周围神经元的发育、分化、生长、再生和功能特性的表达均具有重要的调控作用。
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发表于 2009-6-5 17:28 | 显示全部楼层
大开眼界!太精彩了!!

解决了我多年的疑惑!!
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发表于 2009-6-18 20:39 | 显示全部楼层
太棒了,转到空间。
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 楼主| 发表于 2009-7-23 16:43 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:18 编辑

牛的过氧化氢酶,过氧化氢对细胞有害,过氧化氢酶能即使把其分解为水和氧气

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 楼主| 发表于 2009-7-23 16:51 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:18 编辑

血凝素-----是病毒表面蛋白质。蓝色亚基能抓住人类细胞表面的糖蛋白。


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 楼主| 发表于 2009-7-23 16:57 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:19 编辑

泛素是一种存在于大多数真核细胞中的小蛋白。它的主要功能是标记需要分解掉的蛋白质,使其被水解。当附有泛素的蛋白质移动到桶状的蛋白酶的时候,蛋白酶就会将该蛋白质水解。泛素也可以标记跨膜蛋白,如受体,将其从细胞膜上除去。








泛素的活化:泛素甘氨酸端的羧基连接到泛素活化酶E1的巯基,这个步骤需要以ATP作为能量,最终形成一个泛素和泛素活化酶E1之间的硫酯键。
  E1将活化後的泛素通过交酯化过程交给泛素结合酶E2。
  泛素连接酶E3将结合E2的泛素连接到目标蛋白上,当蛋白上已经存在泛素的时候,结合了E2的泛素可以直接连接在其上而不通过E3。

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 楼主| 发表于 2009-7-23 17:01 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:19 编辑

DNA拓扑异构酶是存在于细胞核内的一类酶,形状像一个箭头,他们能够催化DNA链的断裂和结合










拓扑异构酶II打破了双螺旋结构的DNA



请看下一页



.

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 楼主| 发表于 2009-7-23 17:10 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:07 编辑

这是  David.S.Goodsell教授绘制的肌肉里的肌球蛋白肌动蛋白的连接图解,

可以看到肌球蛋白(红色)的手插入肌动蛋白的凹陷里,肌球蛋白的手发生倾斜,肌动蛋白就会发生移动,

这样一来,我们的肌肉就能收缩了!

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 楼主| 发表于 2009-7-23 17:16 | 显示全部楼层
肌球蛋白的手就是这样把肌动蛋白拉走的!

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 楼主| 发表于 2009-7-23 17:22 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:07 编辑

霍乱弧菌(V.cholera)是一种曾经严重威胁人类生存,迄今仍对人类健康 构成威胁的烈性病原体,其最主要的致病因子是霍乱毒素





霍乱毒素 区域(蓝色)结合膜碳水化合物进入细胞,有毒的部分(红色)

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 楼主| 发表于 2009-7-23 17:33 | 显示全部楼层
20 世纪发现,在不同种属或同种不同系别的个体间进行组织移植时,会出现排斥反应,其本质是细胞表面的同种异型抗原诱导的一种免疫应答。这种代表个体特异性的同种异型抗原称移植抗原或组织相容性抗原,其中能引起强而迅速排斥反应的抗原称主要组织相容性抗原,引起较弱排斥反应的抗原称次要组织相容性抗原





主要组织相容性复合口1( 1hsa )与次要组织相容性复合2(第二1dlh )

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 楼主| 发表于 2009-7-23 17:41 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:08 编辑

这就是我们常说的抗体的样子了!




两边比较大的是他的两只手,两只手前端用来与细菌和病毒等异物结合的部位叫"抗原识别部位"

两只手各抓住异物,把它们连接在一起.

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 楼主| 发表于 2009-7-23 17:51 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:08 编辑

是  David.S.Goodsell教授绘制的细胞质内的情形,原图很大,

大图见这:http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/2/2e/Crowded_cytosol.png








可以看见图片的胞浆,显示微管(淡蓝色) ,肌动蛋白微丝(深兰色) ,核糖体(黄色和紫色) ,可溶性蛋白(淡蓝色) ,驱动蛋白(红色) ,小分子(白色)和RNA (粉红色) 。
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 楼主| 发表于 2009-7-24 18:10 | 显示全部楼层
正被逆转录酶约束的DNA分子(绿色)

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 楼主| 发表于 2009-7-29 17:44 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:09 编辑

α 淀粉酶,存在于口腔和肠道的一种能分解淀粉的消化酶,这就是你咀嚼饭时觉得甜的原因。

图中的黄色部分是陷入活性部位的淀粉分子!




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 楼主| 发表于 2009-7-29 17:52 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:09 编辑

绿色荧光蛋白基因工程创造BFP ,能发出蓝光的蛋白质,红色=锌离子。蓝=荧光。


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发表于 2009-7-31 10:57 | 显示全部楼层
好!谁有这类资料,应该向200719911124学习,发上来大家分享。
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发表于 2009-7-31 11:48 | 显示全部楼层
图文并茂,这帖很有价值!
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 楼主| 发表于 2009-7-31 15:11 | 显示全部楼层
因为我没有学过分子生物学,所以找资料比较麻烦,因为许多原文都是英文,所以要翻译!!
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 楼主| 发表于 2009-8-1 18:00 | 显示全部楼层
本帖最后由 200719911124 于 2010-6-13 12:09 编辑

雌激素受体。如下:雌激素结合域




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 楼主| 发表于 2009-8-8 18:01 | 显示全部楼层
从左到右,
肌球蛋白,微管蛋白,肌动蛋白,胶原蛋白.



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 楼主| 发表于 2009-8-28 15:21 | 显示全部楼层
来自噬菌体整合酶是一种转座的工作,通过内部的酶形成一个X形交叉


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